Covid-19 : pourquoi il faut prendre les indicateurs épidémiologiques avec des pincettes en cette fin d'année 2020

C'est à ne rien y comprendre. Le ministre de la Santé Olivier Véran évoque dans Le Journal du dimanche un virus qui "circule encore trop" avec "15 000 contaminations détectées par jour en moyenne, alors qu'on était descendu à 11 000..." Pourtant, le site du gouvernement affiche le 27 décembre des données bien moins dramatiques, mises à jour le 26 décembre : 3 093 nouvelles contaminations et une évolution dans les dernières 24 heures de l'ordre de -84,7%.

S'agirait-il d'un miracle de Noël ? Malheureusement non, comme on peut s'y attendre, la magie des fêtes n'a pas eu raison du Covid-19. Mais, elle brouille le tableau de suivi épidémiologique. Les chiffres des nouvelles contaminations sont passés de plus de 20 000 à moins de 5 000 en quelques jours et devraient grimper à nouveau. Franceinfo vous explique pourquoi plusieurs indicateurs sont à considérer avec prudence.

Plus de personnes ont été dépistées

Premier indicateur à avoir été bousculé en cette fin d'année : celui du nombre de nouveaux cas positifs. A l'approche des fêtes, le nombre de tests a explosé. Ainsi, du 14 au 20 décembre, "2 272 074 personnes ont été testées pour le Sars-CoV-2" contre 1 304 856 la semaine précédente, d'après Santé Publique France. Ce qui représente une augmentation du nombre de dépistages de 74%. Et "la moitié des tests pratiqués concerne des personnes ne présentant pas de symptômes". 

Les tests réalisés en prévision des retrouvailles familiales ont donc permis d'identifier une plus grande proportion de personnes asymptomatiques, lesquelles passent habituellement sous les radars des autorités sanitaires, mais aussi de tester davantage de personnes saines, ce qui a comme conséquence de baisser le taux de positivité. Par ailleurs, les campagnes de dépistage lancées dans quatre villes françaises à l'approche des fêtes ont également pu contribuer à la baisse trompeuse du taux de positivité.

Le phénomène n'est pourtant pas nouveau : fin mai, la méthode retenue pour les dénombrer nouvelles contaminations a été modifiée, et le nombre de tests réalisés chaque semaine est passé d'environ 200 000 début juin, à plus d'un million début septembre. L'évolution journalière des cas confirmés en France est donc à considérer avec précaution.

Les jours fériés ont tout chamboulé

D'autant plus que ces données peuvent considérablement varier d'un jour à l'autre. La France a enregistré 20 262 nouveaux cas confirmés en vingt-quatre heures vendredi 25 décembre et 3 093 le samedi 26 selon les données publiées sur le site gouvernement.fr. L'écart entre les deux chiffres est conséquent et s'explique assez facilement : le 25 décembre était un jour férié donc de nombreux laboratoires étaient par conséquent fermés.

Moins de tests ont pu être réalisés durant la journée du 25, ce qui induit naturellement une chute du nombre de nouveaux cas positifs recensés le 26 décembre (date de réception des tests). Une diminution semblable est observée depuis le début de l'épidémie les lundis : un nombre important de laboratoires ne travaillent pas le dimanche, donc moins de tests PCR sont réalisés et analysés, ce qui entraîne un recul du nombre de cas positifs déclarés le lundi.

En cette fin d'année, Noël et le Jour de l'an compliquent d'autant plus la tâche des amoureux des chiffres comme le "data scientist" Germain Forestier qu'ils tombent un vendredi. Les chiffres du week-end sont ainsi peu significatifs.

Mise à jour avec les données du 25/12 (22/12 pour les tests) : https://t.co/oGJiH6e9rU

⚠️Probable sous-déclaration au niveau des données hospitalières liée au jour férié.@EricBillyFR @Le___Doc #COVID19france pic.twitter.com/VIZMecd7Bz

— Germain Forestier (@gforestier) December 25, 2020

Les déplacements ont brouillé les cartes

Autre paramètre à garder en tête : la surveillance territoriale de l'évolution épidémique va être influencée par les mouvements de population liés aux vacances. Ces derniers ont une incidence sur la circulation de l'épidémie et sur sa surveillance. Pour éviter une fausse augmentation du taux d'incidence dans les lieux de vacances, des mesures ont toutefois été prises depuis l'été : "Lorsque le code postal de la personne testée est disponible, les données sont attribuées au département et région de résidence", précise Santé publique France.

Cette mesure permet d'établir le suivi d'une population locale et d'évaluer les possibilités d'un rebond épidémique au retour de vacanciers de grandes métropoles par exemple. Toutefois, les hospitalisations sont elles recensées par situation géographique des hôpitaux et non pas par l'origine géographique des patients, pour permettre d'évaluer la tension locale des services de santé. Là encore, les fêtes pourraient brouiller les cartes.